Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf46Q504U0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms