Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms