Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CFAP100Q494V2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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