Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SP6Q3SY56 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SP6Q3SY56 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SP6Q3SY56 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SP6Q3SY56 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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SP6Q3SY56 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SP6Q3SY56 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SP6Q3SY56 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SP6Q3SY56 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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