Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms