Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms