Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf21Q32NC0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms