Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSMPQ1L6U9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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