Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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