Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
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