Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFE2Q16621 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms