Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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