Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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