Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASIC2Q16515 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms