Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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