Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK4Q16099 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms