Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SF1Q15637 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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