Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms