Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RABEP1Q15276 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RABEP1Q15276 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RABEP1Q15276 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RABEP1Q15276 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RABEP1Q15276 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABEP1Q15276 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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