Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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