Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
R3HDM1Q15032 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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