Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms