Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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