Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms