Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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