Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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