Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE4AQ14139 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms