Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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VGLL4Q14135 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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VGLL4Q14135 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
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VGLL4Q14135 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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VGLL4Q14135 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL4Q14135 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL4Q14135 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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