Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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COL4A6Q14031 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL4A6Q14031 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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