Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms