Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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