Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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ITGA9Q13797 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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