Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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