Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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