Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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