Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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