Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN4PQ13434 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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