Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IKZF1Q13422 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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