Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3B2Q13367 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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