Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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RIGQ13278 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIGQ13278 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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