Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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