Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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