Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NME3Q13232 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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NME3Q13232 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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NME3Q13232 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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NME3Q13232 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NME3Q13232 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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