Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TRAF3Q13114 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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