Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms