Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms