Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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