Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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