Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms