Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms